Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYBPC1Q00872 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYBPC1Q00872 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYBPC1Q00872 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms