Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLTCQ00610 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLTCQ00610 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CLTCQ00610 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLTCQ00610 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms