Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HDLBPQ00341 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HDLBPQ00341 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDLBPQ00341 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDLBPQ00341 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 544 ms