Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMF1P82094 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMF1P82094 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TMF1P82094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMF1P82094 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMF1P82094 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMF1P82094 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMF1P82094 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMF1P82094 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMF1P82094 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMF1P82094 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMF1P82094 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMF1P82094 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMF1P82094 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMF1P82094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TMF1P82094 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TMF1P82094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMF1P82094 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMF1P82094 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMF1P82094 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMF1P82094 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMF1P82094 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMF1P82094 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMF1P82094 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMF1P82094 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMF1P82094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMF1P82094 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMF1P82094 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMF1P82094 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMF1P82094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMF1P82094 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMF1P82094 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMF1P82094 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMF1P82094 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TMF1P82094 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMF1P82094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMF1P82094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMF1P82094 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMF1P82094 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMF1P82094 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMF1P82094 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMF1P82094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMF1P82094 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMF1P82094 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMF1P82094 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMF1P82094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TMF1P82094 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMF1P82094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TMF1P82094 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMF1P82094 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMF1P82094 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMF1P82094 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMF1P82094 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMF1P82094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMF1P82094 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMF1P82094 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMF1P82094 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMF1P82094 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMF1P82094 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TMF1P82094 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TMF1P82094 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMF1P82094 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMF1P82094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMF1P82094 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMF1P82094 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMF1P82094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMF1P82094 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMF1P82094 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms