Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP2P81877 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP2P81877 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP2P81877 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms