Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRADDP78560 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRADDP78560 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRADDP78560 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRADDP78560 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRADDP78560 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRADDP78560 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRADDP78560 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRADDP78560 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRADDP78560 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRADDP78560 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRADDP78560 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRADDP78560 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRADDP78560 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRADDP78560 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRADDP78560 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRADDP78560 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRADDP78560 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRADDP78560 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRADDP78560 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRADDP78560 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRADDP78560 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRADDP78560 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRADDP78560 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRADDP78560 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRADDP78560 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRADDP78560 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRADDP78560 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRADDP78560 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRADDP78560 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms