Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
IRX6P78412 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
IRX6P78412 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
IRX6P78412 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IRX6P78412 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX6P78412 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX6P78412 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX6P78412 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX6P78412 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IRX6P78412 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX6P78412 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX6P78412 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IRX6P78412 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX6P78412 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX6P78412 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX6P78412 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX6P78412 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IRX6P78412 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IRX6P78412 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
IRX6P78412 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX6P78412 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX6P78412 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX6P78412 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX6P78412 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IRX6P78412 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX6P78412 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX6P78412 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX6P78412 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IRX6P78412 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
IRX6P78412 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IRX6P78412 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IRX6P78412 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IRX6P78412 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX6P78412 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX6P78412 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX6P78412 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IRX6P78412 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IRX6P78412 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IRX6P78412 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IRX6P78412 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IRX6P78412 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IRX6P78412 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX6P78412 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX6P78412 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX6P78412 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IRX6P78412 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRX6P78412 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRX6P78412 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRX6P78412 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IRX6P78412 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRX6P78412 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRX6P78412 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IRX6P78412 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IRX6P78412 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IRX6P78412 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms