Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA4AP68366 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA4AP68366 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms