Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P68104 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEF1A1P68104 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P68104 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EEF1A1P68104 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P68104 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P68104 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms