Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3EP60228 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3EP60228 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3EP60228 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3EP60228 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms