Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX8P57073 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX8P57073 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX8P57073 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX8P57073 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX8P57073 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX8P57073 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX8P57073 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX8P57073 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX8P57073 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX8P57073 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX8P57073 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX8P57073 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX8P57073 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX8P57073 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX8P57073 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX8P57073 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX8P57073 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX8P57073 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX8P57073 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX8P57073 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX8P57073 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX8P57073 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX8P57073 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX8P57073 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX8P57073 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX8P57073 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX8P57073 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX8P57073 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX8P57073 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX8P57073 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX8P57073 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX8P57073 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX8P57073 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX8P57073 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX8P57073 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX8P57073 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX8P57073 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX8P57073 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms