Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH6P55285 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH6P55285 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH6P55285 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH6P55285 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH6P55285 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH6P55285 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH6P55285 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH6P55285 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH6P55285 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH6P55285 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH6P55285 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH6P55285 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH6P55285 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH6P55285 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH6P55285 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH6P55285 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH6P55285 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH6P55285 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH6P55285 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH6P55285 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH6P55285 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH6P55285 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH6P55285 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH6P55285 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH6P55285 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH6P55285 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH6P55285 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH6P55285 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH6P55285 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH6P55285 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH6P55285 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH6P55285 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH6P55285 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH6P55285 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH6P55285 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH6P55285 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH6P55285 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH6P55285 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH6P55285 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH6P55285 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms