Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCCSP53701 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCCSP53701 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCCSP53701 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCCSP53701 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCCSP53701 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HCCSP53701 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCCSP53701 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HCCSP53701 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCCSP53701 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCCSP53701 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HCCSP53701 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HCCSP53701 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCCSP53701 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCCSP53701 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCCSP53701 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCCSP53701 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCCSP53701 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCCSP53701 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCCSP53701 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCCSP53701 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCCSP53701 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCCSP53701 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCCSP53701 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms