Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDT6P53370 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDT6P53370 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms