Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGDP52209 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGDP52209 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGDP52209 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGDP52209 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGDP52209 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGDP52209 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGDP52209 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGDP52209 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGDP52209 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGDP52209 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGDP52209 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGDP52209 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGDP52209 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGDP52209 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGDP52209 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGDP52209 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGDP52209 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGDP52209 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGDP52209 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGDP52209 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGDP52209 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGDP52209 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGDP52209 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGDP52209 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGDP52209 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGDP52209 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGDP52209 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGDP52209 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGDP52209 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGDP52209 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGDP52209 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGDP52209 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGDP52209 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGDP52209 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGDP52209 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGDP52209 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PGDP52209 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms