Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3P51812 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KA3P51812 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3P51812 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms