Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.71■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
SMARCA2P51531 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SMARCA2P51531 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SMARCA2P51531 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
SMARCA2P51531 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.9 ms