Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV1P50549 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV1P50549 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV1P50549 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV1P50549 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV1P50549 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ETV1P50549 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ETV1P50549 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ETV1P50549 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV1P50549 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV1P50549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV1P50549 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV1P50549 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV1P50549 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV1P50549 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV1P50549 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ETV1P50549 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ETV1P50549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETV1P50549 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETV1P50549 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ETV1P50549 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ETV1P50549 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms