Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP4P49662 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP4P49662 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP4P49662 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP4P49662 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP4P49662 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP4P49662 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP4P49662 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP4P49662 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP4P49662 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP4P49662 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP4P49662 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP4P49662 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP4P49662 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP4P49662 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP4P49662 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP4P49662 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP4P49662 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP4P49662 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP4P49662 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP4P49662 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP4P49662 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP4P49662 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP4P49662 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP4P49662 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP4P49662 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP4P49662 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP4P49662 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP4P49662 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP4P49662 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP4P49662 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP4P49662 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP4P49662 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP4P49662 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP4P49662 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP4P49662 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP4P49662 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP4P49662 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP4P49662 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP4P49662 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP4P49662 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP4P49662 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP4P49662 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP4P49662 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP4P49662 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP4P49662 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP4P49662 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP4P49662 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms