Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMAN1P49257 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMAN1P49257 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.3 ms