Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A6P48664 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A6P48664 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A6P48664 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms