Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSFP46459 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSFP46459 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSFP46459 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSFP46459 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSFP46459 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSFP46459 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSFP46459 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSFP46459 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSFP46459 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSFP46459 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSFP46459 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSFP46459 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSFP46459 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSFP46459 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSFP46459 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSFP46459 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSFP46459 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSFP46459 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSFP46459 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSFP46459 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSFP46459 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSFP46459 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSFP46459 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSFP46459 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSFP46459 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSFP46459 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSFP46459 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSFP46459 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSFP46459 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSFP46459 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSFP46459 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSFP46459 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSFP46459 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSFP46459 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSFP46459 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSFP46459 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSFP46459 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSFP46459 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms