Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACAA2P42765 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAA2P42765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAA2P42765 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms