Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP8P40818 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP8P40818 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP8P40818 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP8P40818 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP8P40818 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP8P40818 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP8P40818 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP8P40818 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP8P40818 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP8P40818 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP8P40818 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP8P40818 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP8P40818 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP8P40818 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP8P40818 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP8P40818 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP8P40818 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP8P40818 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP8P40818 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP8P40818 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP8P40818 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP8P40818 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP8P40818 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP8P40818 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP8P40818 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP8P40818 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP8P40818 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP8P40818 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP8P40818 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP8P40818 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP8P40818 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP8P40818 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP8P40818 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP8P40818 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP8P40818 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP8P40818 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP8P40818 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP8P40818 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP8P40818 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP8P40818 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP8P40818 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP8P40818 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP8P40818 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP8P40818 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms