Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL3P39023 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL3P39023 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL3P39023 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL3P39023 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3P39023 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3P39023 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3P39023 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3P39023 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL3P39023 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3P39023 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3P39023 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3P39023 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL3P39023 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL3P39023 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL3P39023 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3P39023 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3P39023 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL3P39023 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL3P39023 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3P39023 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3P39023 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3P39023 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3P39023 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL3P39023 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL3P39023 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3P39023 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3P39023 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3P39023 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3P39023 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3P39023 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3P39023 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3P39023 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3P39023 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3P39023 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3P39023 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3P39023 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3P39023 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3P39023 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3P39023 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3P39023 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms