Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBRP36941 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBRP36941 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBRP36941 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBRP36941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBRP36941 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBRP36941 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBRP36941 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBRP36941 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBRP36941 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBRP36941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBRP36941 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBRP36941 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBRP36941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBRP36941 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBRP36941 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBRP36941 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBRP36941 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBRP36941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBRP36941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LTBRP36941 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBRP36941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBRP36941 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBRP36941 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBRP36941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LTBRP36941 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBRP36941 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBRP36941 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBRP36941 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBRP36941 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTBRP36941 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBRP36941 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBRP36941 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBRP36941 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBRP36941 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTBRP36941 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTBRP36941 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTBRP36941 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBRP36941 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBRP36941 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LTBRP36941 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LTBRP36941 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBRP36941 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBRP36941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBRP36941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTBRP36941 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBRP36941 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBRP36941 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBRP36941 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBRP36941 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBRP36941 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBRP36941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBRP36941 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms