Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNA7P36544 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNA7P36544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA7P36544 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms