Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN2P35609 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN2P35609 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTN2P35609 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN2P35609 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms