Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
THBS2P35442 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THBS2P35442 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
THBS2P35442 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
THBS2P35442 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS2P35442 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS2P35442 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS2P35442 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS2P35442 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS2P35442 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS2P35442 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS2P35442 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS2P35442 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS2P35442 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS2P35442 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS2P35442 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
THBS2P35442 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms