Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC1P35052 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC1P35052 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC1P35052 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC1P35052 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC1P35052 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC1P35052 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC1P35052 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC1P35052 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC1P35052 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC1P35052 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC1P35052 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC1P35052 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC1P35052 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC1P35052 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC1P35052 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC1P35052 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC1P35052 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC1P35052 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC1P35052 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC1P35052 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC1P35052 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC1P35052 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC1P35052 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC1P35052 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC1P35052 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC1P35052 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC1P35052 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC1P35052 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC1P35052 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC1P35052 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC1P35052 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPC1P35052 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPC1P35052 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPC1P35052 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms