Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSP1P33241 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSP1P33241 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSP1P33241 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSP1P33241 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSP1P33241 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSP1P33241 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSP1P33241 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSP1P33241 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSP1P33241 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSP1P33241 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSP1P33241 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSP1P33241 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSP1P33241 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSP1P33241 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSP1P33241 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSP1P33241 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSP1P33241 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSP1P33241 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSP1P33241 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSP1P33241 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSP1P33241 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSP1P33241 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSP1P33241 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSP1P33241 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSP1P33241 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LSP1P33241 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSP1P33241 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSP1P33241 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LSP1P33241 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LSP1P33241 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms