Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRM2P31350 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRM2P31350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRM2P31350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RRM2P31350 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRM2P31350 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRM2P31350 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRM2P31350 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRM2P31350 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM2P31350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM2P31350 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM2P31350 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM2P31350 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRM2P31350 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRM2P31350 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRM2P31350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM2P31350 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM2P31350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRM2P31350 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms