Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC27P30260 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC27P30260 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC27P30260 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC27P30260 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDC27P30260 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC27P30260 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC27P30260 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC27P30260 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC27P30260 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC27P30260 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC27P30260 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC27P30260 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC27P30260 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC27P30260 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC27P30260 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC27P30260 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC27P30260 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC27P30260 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC27P30260 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC27P30260 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC27P30260 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC27P30260 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC27P30260 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC27P30260 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC27P30260 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC27P30260 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC27P30260 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC27P30260 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC27P30260 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC27P30260 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC27P30260 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC27P30260 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC27P30260 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC27P30260 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC27P30260 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC27P30260 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms