Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRABP1P29762 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRABP1P29762 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRABP1P29762 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRABP1P29762 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRABP1P29762 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRABP1P29762 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRABP1P29762 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRABP1P29762 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRABP1P29762 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRABP1P29762 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRABP1P29762 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRABP1P29762 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRABP1P29762 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRABP1P29762 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRABP1P29762 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRABP1P29762 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRABP1P29762 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms