Protein–RNA interactions for Protein: P29371

TACR3, Neuromedin-K receptor, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR3P29371 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TACR3P29371 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TACR3P29371 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TACR3P29371 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TACR3P29371 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TACR3P29371 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TACR3P29371 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TACR3P29371 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TACR3P29371 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TACR3P29371 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TACR3P29371 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TACR3P29371 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TACR3P29371 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TACR3P29371 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TACR3P29371 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TACR3P29371 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TACR3P29371 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TACR3P29371 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TACR3P29371 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TACR3P29371 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TACR3P29371 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TACR3P29371 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TACR3P29371 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TACR3P29371 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TACR3P29371 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TACR3P29371 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms