Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFS1P28331 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFS1P28331 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms