Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRZ1P23471 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRZ1P23471 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRZ1P23471 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRZ1P23471 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms