Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRGP23470 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PTPRGP23470 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRGP23470 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRGP23470 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRGP23470 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRGP23470 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
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