Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMPD1P23109 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AMPD1P23109 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPD1P23109 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms