Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1D1P20393 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1D1P20393 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1D1P20393 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms