Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFE3P19532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFE3P19532 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFE3P19532 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFE3P19532 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFE3P19532 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFE3P19532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFE3P19532 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFE3P19532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFE3P19532 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFE3P19532 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFE3P19532 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFE3P19532 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFE3P19532 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFE3P19532 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TFE3P19532 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFE3P19532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFE3P19532 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFE3P19532 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFE3P19532 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFE3P19532 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFE3P19532 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFE3P19532 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFE3P19532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFE3P19532 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFE3P19532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFE3P19532 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFE3P19532 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFE3P19532 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TFE3P19532 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFE3P19532 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFE3P19532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFE3P19532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFE3P19532 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFE3P19532 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms