Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1P17174 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1P17174 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1P17174 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1P17174 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1P17174 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1P17174 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1P17174 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1P17174 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOT1P17174 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOT1P17174 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1P17174 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1P17174 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1P17174 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1P17174 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1P17174 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1P17174 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOT1P17174 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOT1P17174 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOT1P17174 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOT1P17174 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOT1P17174 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOT1P17174 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOT1P17174 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOT1P17174 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOT1P17174 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOT1P17174 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOT1P17174 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOT1P17174 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1P17174 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1P17174 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1P17174 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1P17174 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1P17174 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1P17174 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1P17174 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1P17174 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOT1P17174 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOT1P17174 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOT1P17174 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOT1P17174 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1P17174 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOT1P17174 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOT1P17174 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1P17174 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1P17174 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1P17174 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms