Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF43P17038 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF43P17038 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms