Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6AP16499 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6AP16499 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE6AP16499 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6AP16499 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE6AP16499 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms