Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPB42P16452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB42P16452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB42P16452 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB42P16452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPB42P16452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB42P16452 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB42P16452 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB42P16452 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB42P16452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB42P16452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB42P16452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB42P16452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB42P16452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB42P16452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EPB42P16452 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB42P16452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB42P16452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB42P16452 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB42P16452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB42P16452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB42P16452 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB42P16452 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB42P16452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms