Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF4P15884 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF4P15884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF4P15884 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF4P15884 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF4P15884 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF4P15884 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF4P15884 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF4P15884 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF4P15884 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF4P15884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF4P15884 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF4P15884 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF4P15884 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF4P15884 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF4P15884 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF4P15884 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF4P15884 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF4P15884 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF4P15884 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF4P15884 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF4P15884 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF4P15884 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF4P15884 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms