Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT1P13805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT1P13805 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNT1P13805 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms