Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DOBP13765 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DOBP13765 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-DOBP13765 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms