Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT13P13646 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT13P13646 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT13P13646 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT13P13646 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT13P13646 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT13P13646 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT13P13646 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT13P13646 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT13P13646 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT13P13646 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT13P13646 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT13P13646 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT13P13646 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT13P13646 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT13P13646 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT13P13646 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT13P13646 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT13P13646 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT13P13646 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT13P13646 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT13P13646 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT13P13646 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT13P13646 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT13P13646 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT13P13646 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT13P13646 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT13P13646 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT13P13646 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT13P13646 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT13P13646 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT13P13646 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT13P13646 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT13P13646 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT13P13646 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT13P13646 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT13P13646 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT13P13646 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT13P13646 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT13P13646 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT13P13646 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT13P13646 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT13P13646 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT13P13646 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT13P13646 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT13P13646 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT13P13646 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT13P13646 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT13P13646 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT13P13646 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms