Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP3P10745 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP3P10745 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP3P10745 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP3P10745 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBP3P10745 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBP3P10745 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBP3P10745 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP3P10745 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP3P10745 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBP3P10745 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP3P10745 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP3P10745 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP3P10745 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP3P10745 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBP3P10745 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBP3P10745 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBP3P10745 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RBP3P10745 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBP3P10745 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBP3P10745 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBP3P10745 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBP3P10745 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBP3P10745 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBP3P10745 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP3P10745 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP3P10745 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP3P10745 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP3P10745 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBP3P10745 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBP3P10745 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBP3P10745 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBP3P10745 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBP3P10745 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBP3P10745 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBP3P10745 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBP3P10745 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBP3P10745 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBP3P10745 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBP3P10745 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP3P10745 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP3P10745 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBP3P10745 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBP3P10745 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms